一、从源头作好防病工作。播前用种子重量0.3%的70%代森锰锌或75%百菌清拌种。此法能从源头上防止黑斑病、黑腐病、软腐病等病害，为胡萝卜储存打下良好的基础。
二、尽量减少土壤湿度。有些年份特别是农历八月十五前后，胡萝卜生长进入后期时降雨不断，使得低洼地大面积积水。如果不及时把水排除，持续的浸泡足以让胡萝卜出现开裂、多根甚至腐烂症状，与此同时，各种病原物也大量繁殖。收获时，病原体也被随之带入窖中，待到窖里的温度和湿度适宜时，就会大量繁殖成老鼠粪模样的病原物，该病原物的毁灭力经常让成窖的萝卜烂掉，彻底摧毁农民的劳动成果和致富希望。为此，菜农要根据天气预报信息进行田间管理，不要盲目浇水。
三、入窖前的检验。胡萝卜入窖前，在去缨削顶的过程中要做到以下几点：一是宁可多削不少削;二是发现黑心的就地腰斩不入窖;三是宁要小的不要裂的;四是尽可能地让采收的胡萝卜多接受强太阳光的照射，时间不要低于一个半小时。
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